Séquençage métagénomique
Associer le séquençage métagénomique à la métabolomique pour obtenir une vision complète de la fonction du microbiome
L'intégration du séquençage métagénomique et de la métabolomique permet de relier la composition microbienne aux résultats fonctionnels afin de mieux comprendre l'impact du microbiome sur la santé de l'hôte.
- Options de séquençage Flexile
- Outils bioinformatiques puissants pour l'intégration des données
- Les métabolites en tant que résultat phénotypique de la composition de la communauté microbienne
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Analyse multiomique du microbiome
Révéler l'impact du microbiome sur la santé de l'hôte
Le microbiome est aujourd'hui largement reconnu comme un facteur clé de la santé humaine, ayant un impact significatif sur l'immunité, le métabolisme et la susceptibilité aux maladies. Par conséquent, la biologie du microbiome est devenue, à juste titre, un élément clé dans divers domaines de la recherche biomédicale. Un outil essentiel dans ce domaine est le séquençage métagénomique, qui est utilisé depuis longtemps pour évaluer la composition des communautés microbiennes et, plus récemment, pour caractériser le potentiel de codage génétique du microbiome grâce au séquençage en profondeur.
Si la métagénomique identifie les espèces microbiennes et leur potentiel génétique, elle ne saisit pas leurs contributions fonctionnelles, c'est-à-dire ce qu'elles métabolisent activement et qui affecte l'hôte. La métabolomique, qui mesure le répertoire des petites molécules présentes dans un échantillon, comble cette lacune en fournissant une lecture phénotypique de l'activité du microbiome. En intégrant la métagénomique à la métabolomique, les chercheurs peuvent mieux comprendre la composition et la fonction microbiennes ainsi que leur impact sur la santé de l'hôte.
Options de séquençage métagénomique
Le choix de la bonne option de séquençage métagénomique est essentiel pour atteindre les objectifs de l'étude tout en équilibrant le coût et la profondeur des informations nécessaires pour répondre à vos questions de recherche. Metabolon propose plusieurs options de séquençage métagénomique, notamment le séquençage d'amplicons 16S et le séquençage Shotgun à différentes profondeurs optimisées pour les échantillons fécaux. Pour en savoir plus sur nos options de séquençage , cliquez ici. En comprenant parfaitement les objectifs et le budget d'une étude, Metabolon peut aider à sélectionner l'option de séquençage métagénomique qui offre la meilleure valeur et les meilleures informations pour faire avancer vos objectifs de recherche.
Séquençage de l'amplicon (16S)
Le séquençage d'amplicons permet d'évaluer la composition des communautés microbiennes en séquençant des régions caractéristiques du gène de l'ARNr 16S afin de classer les archées et les bactéries.
Séquençage Shotgun, peu profond (3 millions de lectures)
Pour les recherches préliminaires ou les études axées sur les grandes tendances microbiennes, l'option Shallow peut souvent être suffisante pour explorer la composition de la communauté et les différences entre les groupes. Cette option constitue un moyen économique d'obtenir des données suffisantes pour identifier les espèces et les schémas dominants.
Séquençage Shotgun, Balance (15 millions de lectures)
L'option Balance offre un bon équilibre entre le coût et la profondeur des informations. Cette option fournit une vue d'ensemble des espèces dominantes et de certaines espèces moins abondantes et commence à représenter le potentiel de la fonction génique codée par la communauté microbienne.
Séquençage Shotgun, profond (20 millions de lectures)
Pour détecter les espèces microbiennes rares ou effectuer des analyses très détaillées des fonctions génétiques, les options Deep et Ultra Deep offrent les niveaux de détail les plus élevés. L'option Deep offre une couverture approfondie pour capturer une plus grande diversité d'espèces, de microbes rares et de fonctions génétiques rares.
Séquençage Shotgun, Ultra Deep (80 millions de lectures)
Cette option offre une résolution ultra-haute, capable de capturer des espèces rares, des gènes rares et des différences fonctionnelles subtiles induites par de petites variations dans la séquence des gènes. Cette option est particulièrement utile aux chercheurs qui disposent de leur propre équipe de bioinformatique afin d'exploiter au mieux les informations fonctionnelles disponibles dans cette profondeur de données.
Notre solution de recherche sur le microbiome
La solution de recherche sur le microbiome de Metabolonest une offre complète de services pour la génération de données métabolomiques et métagénomiques de haute qualité, l'analyse conviviale de données multiomiques et l'interprétation biologique qui peuvent accélérer votre recherche sur le microbiome.
Global Discovery Panel
La technologie métabolomique de Metabolonpermet de détecter et d'identifier jusqu'à 5 400 métabolites dans un seul échantillon biologique.
Panel microbiome
Un panel métabolomique hautement sélectionné qui recherche plus de 400 petites molécules clés afin d'accélérer la découverte du microbiome.
Outil d'analyse du microbiome
Unifier les données métagénomiques, métabolomiques et phénotypiques au sein d'une plateforme accessible et sans code qui simplifie les analyses complexes.
Ressources en vedette
Découvrez comment la métabolomique et la métagénomique peuvent vous aider à mieux comprendre l'impact du microbiome sur la santé.
eBrochure : Global Discovery Panel
Webinaire en direct : Découvrir les secrets du microbiome
Livre blanc : Conseils pour le séquençage métagénomique
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